Беспозвоночные животные отличаются своими привычками в еде.
Питание кораллов
Кораллы необходимо содержать отдельно в зависимости от вида и потребности в свете. Почти все они питаются за счет находящихся в их теле зооксантелл, которые обеспечивают кораллы путем фотосинтеза питательными веществами и кислородом. Если в воде в достаточных количествах присутствуют кальций, стронций, магний, барий и микроэлементы, светолюбивым кораллам не требуется дополнительного питания (мадрепоровые кораллы). Менее светолюбивые кораллы и мягкие кораллы сумеречных зон часто питаются как растительным, так и животным планктоном. Дисковые анемоны и зоантиды питаются как за счет зооксантелл, так и планктоном. Крупные анемоны часто в качестве корма используют мясо рыб, ракообразных или моллюсков.
Питание ракообразных
Ракообразные питаются водорослями, мелкими беспозвоночными, ведущими прикрепленный образ жизни, и некоторые из них, являясь фильтраторами или падальщиками, утилизируют органические остатки. Креветки в большинстве своем всеядны, некоторые специализируются как чистильщики рыб, некоторые виды поедают кораллы и анемоны.
Питание иглокожих
Большинство морских звезд пасутся на водорослевых лугах, но они питаются и губками, и мшанками. Морские звезды поедают мелких животных и детрит, некоторые питаются моллюсками и падалью.
Питание моллюсков (тридакнов) и других беспозвоночных
Гигантские моллюски питаются преимущественно за счет зооксантелл, в то время как другие фильтруют из воды планктон и мельчайшие частицы. Среди моллюсков есть представители, питающиеся детритом и водорослями, паразитические виды и хищники, поедающие кораллы и морских ежей. Трубчатые черви с помощью своей короны из жаберных лепестков ловят мелкие частицы, губки фильтруют корм из воды.