Среди гетеротрофных бактерий, населяющих воду морей и океанов, особо выделяется группа светящихся бактерий. Эти бактерии способны излучать свет без какой-либо внешней стимуляции за счет энергии своего метаболизма (Чумакова, Гительзон, 1975; Примакова, 1984). Они представляют собой подвижные палочки, близкие к группе энтеробактерий — обитателей кишечника животных. По своему систематическому положению отдельные их вида относятся к родам Photobacterium, Vibrio и Beneckia. Полагают, что основным ареалом обитания светящихся бактерий служит кишечник морских животных, а также их светящиеся органы. В состав бактериопланктона они попадают с фекалиями или покидая светящиеся органы животных. Находясь в воде, они вместе с бактериопланктоном или частицами детрита потребляются водными животными и таким образом распространяются среди их популяции.
Светящиеся бактерии используются в настоящее время для получения ферментных препаратов люциферазы. Поэтому выделение культур этих бактерий представляет практический интерес. Исследования показали, что содержание светящихся бактерий в воде над рифами более чем на порядок выше, чем в водах открытого океана. Оно варьирует в пределах 103-104 кл/л при общей численности сапрофитных бактерий 104-106. Иногда до половины от общего числа сапрофитных бактерий представлено светящимися формами (Чумакова, Гительзон, 1975). Преобладающая часть светящихся бактерий находится на поверхности детритных частиц размером более 3-8 мкм. Они в большом количестве присутствуют на поверхности талломов макрофитов, а также в кишечниках и на поверхности тела многих морских животных, таких, как рыбы, кораллы, моллюски голотурий. Светящиеся бактерии составляют 1-4% от общего числа сапрофитных бактерий, которые высеваются из донных субстратов. Таким образом, светящиеся бактерии в значительной степени связаны с обитателями рифа.