На мелководьях флета многих рифов зоантарии образуют обширные видовые ассоциации в виде пятен и даже поясов (Suchanek, Green, 1981; Sebens, 1982; Karlson, 1983; Faddallah et аl., 1984). Их поселения встречаются на осушаемом гребне флета, на скальных его поверхностях (род Palythoa), на обломочном материале и на мертвых колониях кораллов (роды Zoanthus и Isaurus) и даже на живых колониях акропор (род Zoanthus). Они весьма устойчивы к физическому стрессу и к антропогенному воздействию (Cooke, 1976). В этих условиях они вытесняют другую сидячую фауну, включая склерактиний (Walsh, Bowers, 1977). Поэтому они легко колонизируют ослабленные или загрязняемые рифы. На загрязняемых гавайских рифах у о-ва Оаху и заливе Канеохе мы наблюдали обширные площадки до десятка квадратных метров, на которых отмершие кораллы были покрыты ковром зоантарий Zoanthus pacificus и Palythoa vestitus. Они селятся также и на лагунных патч-рифах, где обычно бывает много отмерших кораллов и обломочного материала. Большие поселения зоантарий Z. sociatus можно встретить на скоплениях обломочного материала в зоне рва. Эти скопления часто прорастают колониями зоантарий на всю свою глубину.
Все зоантарии содержат симбиотические зооксантеллы и способны потреблять зоопланктон. Скорость их латерального роста достаточно высока — до 1-1,5 см в месяц (Karlson, 1983). Поэтому они могут перерастать и вытеснять конкурентов за субстрат. Размножаются они главным образом вегетативно, хотя им свойственно и половое размножение. Смертность зоантарий высока и обусловлена в основном воздействием волн и выеданием. Зоантарии выедают некоторые ежи и рыбы, нечувствительные к вырабатываемым ими токсинам (Cooke, 1976). Среди них ежи Diadema, полихеты Hormodice, а также некоторые рыбы-помацетриды. Однако зоантарии быстро восстанавливают свои популяции, поврежденные штормами или интенсивным выеданием (Karlson, 1983). Зоантарии и их роль в сообществах рифов изучены пока недостаточно. Однако в последнее время интерес к ним растет в связи с обнаружением в некоторых из них (Palythoa) биологически активных веществ токсинов, представляющих интерес для фармакологии (Moore, Sheuer, 1971; Kimura et аl., 1971). Рыбы, питающиеся зоантариями Palythoa, также становятся токсичными (Hashimoto et аl., 1969).