Семейство Clupeidae (сельди). Мелкие пелагические стайные рыбы этого семейства являются обьиными обитателями лагун атоллов. Их размеры 3-8 см. Они часто образуют большие стаи вблизи берега лагуны и патч-рифов. В числе наиболее массовых родов рифовых сельдей: Harengula, Jenkinsia, Sardinella. В состав этого семейства входит подсемейство Dussumieridae — круглые сельди. Это мелкие стайные рыбы-планктофаги 2—7 см длиной. Часто в больших количествах скапливаются у подветренного края рифа или в больших расщелинах флета, а также в лагунах. Массовыми видами этого семейства, обитающими в зоне рифов, являются Spratelloides dclicatulus, S. atrufasciatus, S. graciloides, Allanetta ovalua, Dussumieria hasselti. Рифовые сельди произошли от пелагических сельдевых, являющихся типичными планктофагами. Однако в условиях рифа они в значительной мере изменили свое пищевое поведение и наряду с зоопланктоном стали питаться также и бентосом, потребляя мелких донных ракообразных и полихет.
Семейство Hemiramphidae (полурылы). В состав этого семейства входят весьма распространенные в водах, прилегающих к рифам, пелагические рыбы с игловидным телом. Эти рыбы питаются в основном зоопланктоном, фитопланктоном, обрывками талломов водорослей и морских трав. Характерным адаптивным признаком этих рыб является неравная длина челюстей: верхняя челюсть у них в несколько раз короче вытянутой нижней челюсти. Такое строение ротового аппарата облегчает сбор организмов из поверхностной пленки. Массовыми видами этого семейства, обитающими в зоне рифов, являются: Hemiramphus melanochir, Н. brasiliensis, Н. balao, Hyporamphus acutus, Н. dussumieri. Первые два вида наряду с зоопланктоном потребляют много растительной пищи (макрофитов, морские травы). Н. dussumeri питается в значительной мере фитопланктоном (Williams, Hatcher, 1983).
Семейство Cirrhitidae (кудреперы, рыбы-ястребы). Включает мелких рыб с размерами 4-10 см, которые охотятся за зоопланктоном из засады. Эти рыбки сидят в засаде, маскируясь на субстрате, и периодически делают выпады, похожие на "клевки", схватывая проплывающий мимо зоопланктон. Они охотятся также и на донных ракообразных, на мелких крабов. Среди них есть виды, которые охотятся только днем или только ночью, а также виды, которые охотятся круглосуточно. В числе их массовых видов можно отметить такие, как Amblycirrhites arcatus, А. bimacula, Cirrhitus pinnulatus, Paracirrhites arcatus, Р. forsteri, Oxycirrhites typus.
Семейство Syngnathidae (морские иглы). Это семейство включает небольшое число видов специализированных рыб-планктофагов, обитающих в водах лагун. Размер их 8-10 см. Челюсти этих рыб вытянуты в тонкую трубочку, с их помощью они собирают планктон, засасывая его как пипеткой. Некоторые их этих рыбок плавают в вертикальном положении. В числе наиболее распространенных видов этого семейства можно указать: Corythoichthys haemopteris, С. flavofasciatus. Doryrhamphus melanopluza.
Семейство Congridae (садовые угри). Это небольшие змеевидные рыбы (30-60 см), живущие в норках с большими колониями на песчаном дне лагуны или подножия рифа (зона фор-рифа). Они сидят в норках, выставив до половины свое тело, и ждут добычу - проносимых мимо них течением планктонных рачков, икринки или личинки рыб (Randall, 1967; Fricke, 1973). В числе массовых их видов: Nytstactichtys halis. Taenioconger halis, Gorgasia sillneri, Haliophis guttatus, Conger cinereus. Arisoma sheelei.